“我們剛剛又完成了2000份玉米種質資源的基因測序和數(shù)據分析工作，給這些種子建立了‘數(shù)字身份證’，今后的生物育種將更加精準、高效?！?0月25日，在江蘇省農業(yè)種質資源綜合基因庫，江蘇省農業(yè)科學院（以下簡稱江蘇省農科院）種質資源與生物技術研究所玉米種質資源創(chuàng)新團隊副研究員周玲說著打開數(shù)據庫。科技日報記者看到這里面已經儲存了近1萬份種質資源基因組測序分析數(shù)據。

　　2020年6月，江蘇省農業(yè)科學院在國內率先搭建數(shù)字化育種平臺，開展大規(guī)模種質資源基因測序和數(shù)據分析，目前已完成2352份水稻、5082份玉米、1344份桃、366份草莓、473份辣椒等種質資源的數(shù)字化存儲。

　　種業(yè)創(chuàng)新是農業(yè)科技創(chuàng)新的核心問題，開展種源“卡脖子”技術攻關，首先要把種質資源保護利用好。

　　“目前，江蘇省農作物種質資源中期庫已收集保存農作物種質資源5.7萬份，涵蓋54種作物，涉及14個植物科、56個屬和96個物種?！苯K省農科院種質資源與生物技術研究所所長趙涵介紹，其中水稻種質資源15000余份、小麥種質資源15000余份、玉米種質資源6000余份，具有鮮明的地方特色，包括長江中下游尤其是太湖流域的水稻地方品種、南方六省一市冬麥區(qū)的小麥地方品種、江蘇地方糯玉米品種。

　　當前，以“新一代數(shù)字科技與生物技術深度融合”為特征的智慧育種時代正加速到來，中國種業(yè)發(fā)展面臨前所未有的機遇與挑戰(zhàn)。構建數(shù)字化育種平臺，實現(xiàn)育種數(shù)據化、網絡化、智能化，已成為提升育種效能的主流趨勢和根本方法。

　　建設先進的數(shù)字化種質資源平臺是夯實種質資源基礎的關鍵。今年2月，《國務院關于印發(fā)“十四五”推進農業(yè)農村現(xiàn)代化規(guī)劃的通知》指出，要加強種質資源保護，構建種質資源DNA分子指紋圖譜庫、特征庫和農業(yè)種質資源數(shù)據庫。

　　趙涵說，數(shù)字化育種平臺通過構建高精度模型、結合基因編輯技術，能夠先預測育種，既省去田間播種試驗的大量人力，又節(jié)省了實驗時間、提高了科研效率。

　　“一株水稻的基因數(shù)據量可達400M左右，一個平常的64G閃存盤只能存儲十幾株水稻的基因組數(shù)據?！壁w涵介紹，生物基因組的數(shù)量十分龐大，建設數(shù)字化的種質資源庫亟須海量存儲和高性能計算技術，才能為接下來的人工智能育種打下基礎。

　　“目前，數(shù)字化育種平臺的整體架構設計已初步完成，主要由表型數(shù)據庫、基因型數(shù)據庫、數(shù)據計算和分析平臺3個模塊組成?！敝芰峤榻B，一粒種子從實物變成基因數(shù)據并不容易：首先在田地里種下種子，長大后從葉片中提取DNA進行質檢；第二步是送到實驗室對樣品進行處理和上機測序，獲得基因組上的小片段；最后再利用生物信息學軟件，將序列信息轉化為可靠的變異信息，再對變異的信息進行判讀。

　　周玲解釋說，每一種生物都有標準的參考基因組，只有進行對比后才能判定檢測的種質資源是否變異，這樣就能從基因組層面追溯種子來源，為種子建立一個獨一無二的“數(shù)字身份證”。

　　目前，江蘇省農科院與相關企業(yè)合作開發(fā)的變異過濾軟件，一天可分析30—40個玉米品種，比傳統(tǒng)軟件分析速率提升約40倍。

　　“下一步，我們將聚焦個別優(yōu)勢種質資源（例如水稻、草莓），根據專業(yè)特點開展具體實施和分工合作，完成平臺框架的搭建?！壁w涵說，未來數(shù)據庫建立完成后，結合數(shù)據分析與育種分子技術，將形成一個現(xiàn)代化的數(shù)字育種平臺。（張曄）